El proyecto tiene como objetivo desarrollar vacunas autógenas sitio-específicas para la salmonicultura chilena a través de técnicas moleculares que permitan identificar patógenos específicos de forma inequívoca. Las vacunas autógenas son producidas con la misma cepa precisa que causa la enfermedad en el grupo a tratar. El proyecto se basa en la detección de genes y la comparación de sus secuencias. El empleo de diferentes genes permite distinguir especies bacterianas y clasificarlas según su género, especie, tipo o subtipo. Su aplicación requiere de experiencia y de sólidos conocimientos en biología molecular para la interpretación de los resultados y la solución de problemas que surgen frecuentemente cuando se emplea material de origen diverso. La eficiencia en esta identificación inequívoca del patógeno dependerá principalmente del empleo de los marcadores moleculares apropiados y la generación de una base de datos amplia de tales marcadores. Esta base contendrá patógenos, patógenos potenciales y también no patógenos frecuentemente presentes en los sitios de cultivo. La propuesta de la innovación a desarrollar consiste en ofrecer a los productores acuícolas un servicio íntegramente ejecutado en chile que incluirá: 1) El aislamiento del patógeno responsable de un determinado foco de enfermedad, detectada por los médico-veterinarios del productor y con conocimiento de la autoridad sanitaria de Sernapesca y Sag cuando corresponda reglamentariamente, 2) La caracterización microbiológica y molecular del o los microorganismos, 3) La preparación de la vacuna autógena correspondiente 4) Las pruebas de seguridad e inocuidad en acuarios 5) El seguimiento en terreno del efecto de la autovacuna que se aplica en los planteles afectados.